Геном вірусу гепатиту В людини (HBV) існує у вигляді дволанцюгових кільцевих молекул ДНК і містить чотири ORF гени, які кодують біли цього вірусу. Регіон S (pre-S1, pre-S2) кодує поверхневий антиген гепатиту B - HBsAg. С і pre-С регіони кодують HBсAg і HBeAg, відповідно. Х регіон кодує поліпептид, який експресується під час зараження вірусом. Р регіон кодує білок, що бере участь у реплікації. Ідентифіковано чотири класи HBV мРНК, довжиною 3,5, 2,4, 2,1 і 0,9 тисяч основ. Експресія усіх мРНК контролюється чотирма різними промоторами.